conumee

DOI:10.18129 / B9.bioc.conumee

增强人类基因组变异分析使用Illumina公司DNA甲基化数组

Bioconductor版本:版本(3.6)

这个包包含一组处理和绘制方法进行人类基因组变异(CNV)的分析使用Illumina公司450 k或史诗甲基化数组。

作者:Volker Hovestadt, Marc Zapatka

维护人员:Volker Hovestadt < conumee在hovestadt.bio >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

HTML	R脚本	conumee
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细节

biocViews	CopyNumberVariation,DNAMethylation,MethylationArray,微阵列,归一化,预处理,质量控制,软件
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(3年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.0),minfi,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19,IlluminaHumanMethylationEPICmanifest
进口	方法、统计数据DNAcopy,rtracklayer,GenomicRanges,IRanges,GenomeInfoDb
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,minfiData,RCurl
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	conumee_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	conumee_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	conumee_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/conumee
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/conumee/
包下载报告	下载数据