consensusOV

DOI:10.18129 / B9.bioc.consensusOV

基于基因表达的高级别浆液性卵巢癌亚型分类

Bioconductor版本:Release (3.6)

该包实现了Helland等人(PLoS One, 2011)、Bentink等人(PLoS One, 2012)、Verhaak等人(J clinin Invest, 2013)和Konecny等人(J Natl cancer Inst, 2014)所描述的高级别浆液性(HGS)卵巢癌的四个主要亚型分类器。此外，该软件包实现了一个共识分类器，它巩固和改进了所提出的亚型分类器的稳健性，从而为明确界定亚型的HGS卵巢肿瘤患者提供可靠的分层。

作者:Gregory M Chen, Lavanya Kannan, Ludwig Geistlinger, Victor Kofia, Levi Waldron, Benjamin habe- kains

维护者:Benjamin Haibe-Kains < Benjamin .haibe。Kains at utoronto.ca>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“consensusOV”)

文档

超文本标记语言	R脚本	卵巢癌的分子分型
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类，聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，微阵列，软件，转录组
版本	1.0.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4)
进口	Biobase，GSVA，gdata，genefu，limma，matrixStats，randomForest，统计，效用
链接
建议	knitr，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.pmgenomics.ca/bhklab/software/consensusOV
BugReports	https://github.com/bhklab/consensusOV/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	consensusOV_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	consensusOV_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	consensusOV_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/consensusOV
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/consensusOV/
软件包下载报告	下载数据