cobindR

DOI:10.18129 / B9.bioc.cobindR

发现共现图案的转录因子结合位点

Bioconductor版本:版本(3.6)

发现和分析共现图案组基因的转录因子结合位点

作者:曼Benary, Stefan Kroeger Yuehien李,罗伯特·莱曼

维护人员:曼Benary <曼。在cms.hu-berlin.de benary >

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PDF	R脚本	使用cobindR
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文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology,ChIPSeq,MultipleComparison,SequenceMatching,软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	方法,seqinr,yaml,rtfbs,gplots,mclust,gmp,BiocGenerics(> = 0.13.8),IRanges,Biostrings,BSgenome,biomaRt
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了	rGADEM,seqLogo,genoPlotR平行,维恩图,RColorBrewer,vcd,MotifDb,降雪
URL
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进口我
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包档案

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源包	cobindR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	cobindR_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	cobindR_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cobindR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cobindR/
包下载报告	下载数据