cleanUpdTSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.cleanUpdTSeq

这个包分类假定的聚腺苷酸化网站为真或假/内部oligodT影射

Bioconductor版本:版本(3.6)

这个包使用朴素贝叶斯分类器(从e1071)分配概率值假定的聚腺苷酸化网站(pA)网站从斑马鱼基于训练数据。这将允许用户独立真的,生物相关的爸爸从虚假网站,oligodT pA网站。

作者:莎拉•谢泼德Jianhong Ou,内森·劳森丽华朱莉朱

维护人员:莎拉·谢泼德<萨拉。谢泼德在umassmed.edu >;Jianhong Ou <,或者在umassmed.edu >;利华国际朱莉朱<朱莉。朱:umassmed.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“cleanUpdTSeq”)

文档

HTML	R脚本	cleanUpdTSeq装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation,遗传学,SequenceMatching,测序,软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.15),BiocGenerics(> = 0.1.0)、方法BSgenome,BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7,GenomicRanges,seqinr,e1071
进口
链接
建议	BiocStyle,knitr,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	InPAS
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cleanUpdTSeq_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	cleanUpdTSeq_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	cleanUpdTSeq_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cleanUpdTSeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cleanUpdTSeq/
包下载报告	下载数据