chromPlot

DOI:10.18129 / B9.bioc.chromPlot

基因组数据的全球可视化工具

Bioconductor版本:Release (3.6)

沿着染色体可视化基因组数据的包,其中垂直染色体按数量排序,性染色体在最后。

作者:Ricardo A. Verdugo和Karen Y. Orostica

维护者:Karen Y. Orostica

引文(从R内,输入引用(“chromPlot”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“chromPlot”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“chromPlot”)

PDF R脚本 一般的手动
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释DataRepresentationFunctionalGenomics遗传学测序软件可视化
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 统计,utils,图形,grDevices,数据集,基础,biomaRtGenomicRanges, r (>= 3.1.0)
进口
链接
建议 qtlGenomicFeaturesTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 chromPlot_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 chromPlot_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) chromPlot_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chromPlot
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/chromPlot/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网