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chimeraviz
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DOI:10.18129 / B9.bioc.chimeraviz
基因融合的可视化工具
Bioconductor版本:Release (3.6)
Chimeraviz管理来自融合基因发现者的数据，并提供有用的可视化工具。
作者:Stian Lågstad [aut, cre]， Sen Zhao [ctb]， Andreas M. Hoff [ctb]， Bjarne Johannessen [ctb]， Ole Christian Lingjærde [ctb]， Rolf Skotheim [ctb]
维护者:Stian Lågstad
引文(从R内，输入引用(“chimeraviz”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“chimeraviz”)
文档
| 超文本标记语言 | R脚本 | chimeraviz |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐，基础设施，软件 |
| 版本 | 3 |
| 在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(1年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | Biostrings，GenomicRanges，IRanges，Gviz，S4Vectors，ensembldb，AnnotationFilter |
| 进口 | 方法,readr、网格Rsamtools，GenomeInfoDb，GenomicAlignments，RColorBrewer、图形、AnnotationDbi，RCircos，org.Hs.eg.db，rmarkdown，图，Rgraphviz，DT，plyr，dplyr，BiocStyle，ArgumentCheck |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，roxygen2，devtools，knitr |
| SystemRequirements | 有些功能需要Bowtie、samtools和egrep |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/stianlagstad/chimeraviz |
| BugReports | https://github.com/stianlagstad/chimeraviz/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | chimeraviz_1.4.3.tar.gz |
| Windows二进制 | chimeraviz_1.4.3.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | chimeraviz_1.4.3.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimeraviz |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/chimeraviz/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.6的旧源包 | 源存档 |
