生物导体版本:版本(3.6)
计算两个(或更多)特征(即基因)列表中的每个特征中的重要注释(类别),确定注释之间的重叠,并返回有关显着注释的图形和表格数据,以及特征的组合列表,注释被发现为注释。重要的。通过使用rcytoscape(大量建议)来促进交互式探索。
作者:Robert M. Flight
维护者:Robert M. Flight
引用(从r内,输入引用(“类别Compare”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ categorycompare”)
html | R脚本 | 类别Compare:使用基因注释的高通量数据荟萃分析 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,去,,,,基因表达,,,,多重组合,,,,途径,,,,软件 |
版本 | 1.22.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.10(R-2.15)(6年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 2.10),生物酶,,,,生物基因(> = 0.13.8) |
进口 | AnnotationDbi,,,,HWRITER,,,,gseabase,,,,类别(> = 2.33.1),gostats,,,,注释,,,,色彩空间,,,,图形,,,,RCY3 |
链接 | |
建议 | 尼特, 方法,go.db,,,,kegg.db,,,,雌激素,,,,org.hs.eg.db,,,,HGU95AV2.DB,,,,林玛,,,,副词,,,,GeneFilter |
系统要求 | Cytoscape(> = 3.2.1)(如果用于可视化结果,则大量建议) |
增强 | |
URL | https://github.com/rmflight/categorycompare |
BugReports | https://github.com/rmflight/categorycompare/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | 类别Compare_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | 类别Compare_1.22.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | 类别Compare_1.22.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/categorycompare |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/categorycompare/ |
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