bsseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.bsseq

分析、管理和存储亚硫酸氢盐测序数据

Bioconductor版本:Release (3.6)

一组分析和可视化亚硫酸氢盐测序数据的工具。

作者:Kasper Daniel Hansen [aut, cre]， Peter Hickey [aut]

维护者:Kasper Daniel Hansen

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“bsseq”)

文档

超文本标记语言	R脚本	用bsseq分析WGBS数据
超文本标记语言	R脚本	bsseq用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，软件
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.3)，方法，BiocGenerics，GenomicRanges(> = 1.29.14),SummarizedExperiment(>= 1.7.8)，平行
进口	IRanges(> = 2.11.16),GenomeInfoDb，尺度，统计，图形，Biobase，locfit，gtools，data.table，S4Vectors，R.utils(> = 2.0.0),matrixStats(> = 0.50.0),交换，limma，DelayedArray，HDF5Array
链接
建议	RUnit，bsseqData，BiocStyle，rmarkdown，knitr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kasperdanielhansen/bsseq
BugReports	https://github.com/kasperdanielhansen/bsseq/issues
全靠我	bsseqData，DSS
进口我	米拉
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	bsseq_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	bsseq_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	bsseq_1.14.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bsseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bsseq/
软件包下载报告	下载数据