birte

DOI:10.18129 / B9.bioc.birte

贝叶斯推理的监管影响表达式(biRte)

Bioconductor版本:版本(3.6)

信使rna分子的表达水平是由不同的过程,包括抑制或激活转录因子和转录后降解小分子核糖核酸。biRte使用TFs的监管网络,microrna可能还有其他因素,加上mRNA,以及其他可利用的microrna的表达数据预测的相对影响力监管者目标基因的表达。在贝叶斯推理完成使用Markov-Chain-Monte-Carlo建模框架。一个特殊特性是后续网络的可能性之间的反向工程活动监管机构。

作者:Holger Froehlich, Benedikt米基罗的贡献

维修工:Holger Froehlich < frohlich在bit.uni-bonn.de >

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PDF	R脚本	贝叶斯推理的转录活动的监管
PDF		参考手册
文本		自述

细节

biocViews	贝叶斯,GeneExpression,微阵列,网络,NetworkInference,回归,测序,软件,转录
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(3年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.0.0),RcppArmadillo(> = 0.3.6.1),Rcpp
进口	质量,limma(> = 3.22.0),glmnet,Biobase,nem、图形数据,跑龙套
链接	RcppArmadillo,Rcpp
建议	knitr
SystemRequirements	布拉斯特区,LAPACK
增强了	Rgraphviz
URL
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包档案

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源包	birte_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	birte_1.14.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	birte_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/birte
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/birte/
包下载报告	下载数据