生物签名

doi:10.18129/b9.bioc.biosigner

从OMICS数据发现的签名发现

生物导体版本:版本(3.6)

特征选择在OMICS数据分析中至关重要,可以从复杂和高维数据中提取受限和有意义的分子特征,并构建强大的分类器。该软件包实现了一种新方法,以评估变量与分类器的预测性能的相关性。该方法可以与PLS-DA,随机森林和SVM二元分类器并行运行。返回签名和相应的“限制”模型,从而在新数据集上进行未来的预测。该软件包的星系实现可用于计算代谢组学的WorkFlow4Metabolomics.org在线基础架构。

作者:philippe rinaudo ,etienne thevenot

维护者:philippe rinaudo ,etienne thevenot

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细节

生物浏览 分类,,,,特征提取,,,,脂质组学,,,,代谢组学,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(2年)
执照 塞西尔
要看
进口 方法,E1071,,,,Randomforest,,,,ropls,,,,生物酶
链接
建议 生物标志,,,,运行,,,,生物基因,,,,生物使用,,,,golubeset,,,,Hu6800.db,,,,尼特,,,,rmarkDown
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源包 BioSigner_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 BioSigner_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) BioSigner_1.6.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biosigner
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biosigner/
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