bioassayR

DOI:10.18129 / B9.bioc.bioassayR

Cross-target小分子生物活性的分析

Bioconductor版本:版本(3.6)

bioassayR是一种计算工具,使成千上万的生物测定实验进行的同时分析了一组不同的化合物和生物的目标。独特的功能,包括支持大规模cross-target分析公共和定制的生物,一代的高通量筛选指纹(HTSFPs),和一个可选的预加载数据库提供公开的生物活性数据的很大一部分。

作者:泰勒后方,罗恩Schlenk,托马斯Girke

维护人员:泰勒后方< tbackman在lbl.gov >

从内部引用(R,回车引用(“bioassayR”)):

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细节

biocViews 生物信息学,CellBasedAssays,DataImport,基础设施,代谢组学,MicrotitrePlateAssay,蛋白质组学,软件,可视化
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 2.13 (r - 3.0)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.1.0),DBI(> = 0.3.1),RSQLite(> = 1.0.0)、方法矩阵,rjson,BiocGenerics(> = 0.13.8)
进口 XML,ChemmineR
链接
建议 BiocStyle,RCurl,biomaRt,cellHTS2,knitr,knitcitations,knitrBootstrap,testthat,ggplot2,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/TylerBackman/bioassayR
BugReports https://github.com/TylerBackman/bioassayR/issues
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源包 bioassayR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 bioassayR_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) bioassayR_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioassayR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/bioassayR/
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