- 首页
- Bioconductor 3.6
- 软件包
- beadarray
beadarray
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.beadarray
Illumina BeadArray数据的质量评估和底层分析
Bioconductor版本:Release (3.6)
该包能够读取由BeadScan输出的串珠级数据(原始tiff和文本文件)以及来自BeadStudio的串珠摘要数据。提供了质量评价和低层次分析的方法。
作者:马克·邓宁，迈克·史密斯，乔纳森·凯恩斯，安迪·林奇，马特·里奇
维护者:Mark Dunning
引文(从R内，输入引用(“beadarray”))：
安装
要安装这个包，开始R，然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“beadarray”)
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“beadarray”)
| R脚本 | beadarray.pdf | |
| R脚本 | beadlevel.pdf | |
| R脚本 | beadsummary.pdf | |
| R脚本 | ImageProcessing.pdf | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 微阵列，OneChannel，预处理，质量控制，软件 |
| 版本 | 2.28.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 1.8 (R-2.3)(12年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 2.13.0)，BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(>= 2.17.8)，方法，ggplot2 |
| 进口 | BeadDataPackR，limma，AnnotationDbistats4,reshape2，GenomicRanges，IRanges，illuminaio |
| 链接 | |
| 建议 | 光民，vsn，affy，hwriter，beadarrayExampleData，illuminaHumanv3.db，gridExtra，BiocStyle，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，ggbio，喷嘴。R1，knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | beadarrayExampleData |
| 进口我 | arrayQualityMetrics，BeadArrayUseCases，blima，epigenomix |
| 建议我 | beadarraySNP，blimaTestingData，光民 |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | beadarray_2.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | beadarray_2.28.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | beadarray_2.28.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beadarray |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/beadarray/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
