舞会礼服

DOI:10.18129 / B9.bioc.ballgown

灵活,isoform-level微分表达式分析

Bioconductor版本:版本(3.6)

组装转录组的统计分析工具,包括灵活的微分表达式分析、文本结构的可视化,匹配组装记录注释。

作者:杰克傅(aut) Alyssa c Frazee (aut (cre),莱昂纳多Collado-Torres (aut),杰弗里·t·安德鲁·e·贾菲(aut)韭菜(aut,黑色)

维护人员:杰克傅< jmfu jhsph.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“舞会礼服”)

文档

HTML	R脚本	灵活isoform-level微分表达式分析舞会礼服
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,预处理,RNASeq,软件,StatisticalMethod
版本	2.10.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.1.1)方法
进口	GenomicRanges(> = 1.17.25),IRanges(> = 1.99.22),S4Vectors(> = 0.9.39),RColorBrewer样条函数,股东价值分析,limma,rtracklayer(> = 1.29.25),Biobase(> = 2.25.0),GenomeInfoDb
链接
建议	testthat,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/alyssafrazee/ballgown/issues
取决于我
进口我
建议我	聚酯,variancePartition
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ballgown_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	ballgown_2.10.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	ballgown_2.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ballgown
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ballgown/
包下载报告	下载数据