ArrayQualityMetrics

doi:10.18129/b9.bioc.ArrayqualityMetrics

微阵列数据集的质量指标报告

生物导体版本:版本(3.6)

该软件包生成微阵列质量指标报告,用于生物导体微阵列数据容器中的数据(Expressionset,Nchannelset,affybatch)。支持一个和两个颜色阵列平台。

作者:奥黛丽·考夫曼(Audrey Kauffmann),沃尔夫冈·胡伯(Wolfgang Huber)

维护者:迈克·史密斯(Mike Smith)

引用(从r内,输入引用(“ arrayqualitymetrics”)):

安装

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文档

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PDF R脚本 高级主题:自定义ArrayqualityMetrics报告和输出的程序化处理
PDF R脚本 简介:带有阵列的微阵列质量评估
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,QualityControl,,,,报告写作,,,,软件,,,,两通道
版本 3.34.0
在生物导体中 Bioc 2.1(R-2.6)(10。5年)
执照 LGPL(> = 2)
要看
进口 副词,,,,affyplm(> = 1.27.3),Beadarray,,,,生物酶,,,,开罗(> = 1.4-6),GeneFilter,图形,grdevices,网格,网格(> = 1.4-3),HMISC,,,,HWRITER,,,,格子,,,,LatticeExtra,,,,林玛, 方法,rcolorbrewer,,,,setrng,统计,utils,VSN(> = 3.23.3),XML
链接
建议 allmll,,,,CCL4,,,,生物使用,,,,尼特
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/grimbough/arrayqualitymetrics/issues
取决于我
进口我 埃加德
建议我
构建报告

包装档案

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源包 arrayqualitymetrics_3.34.0.tar.gz
Windows二进制 arrayqualitymetrics_3.34.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) arrayqualitymetrics_3.34.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/arrayqualitymetrics
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/arrayqualitymetrics/
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