anamiR

DOI:10.18129 / B9.bioc.anamiR

miRNA和mRNA表达数据的集成分析包

Bioconductor版本:Release (3.6)

该包旨在从miRNA和mRNA表达数据中识别miRNA-靶基因相互作用的潜在相互作用。它包含统计检验功能、mirna -靶基因相互作用数据库和功能分析。

作者:王铁泰[aut, cre]，吕子品[aut]，李建岳[ctb，]庄志强[aut]

维护人员:Ti-Tai Wang

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“anamiR”)

文档

超文本标记语言	R脚本	anamiR简介
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文本		新闻

细节

biocViews	AssayDomain，BiologicalQuestion，DifferentialExpression，GeneExpression，GeneRegulation，GeneSetEnrichment，GeneTarget，遗传学，微阵列，归一化，通路，ResearchField，测序，软件，技术，WorkflowStep，microrna的
版本	1.6.1
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.3.3)，SummarizedExperiment(> = 1.1.6)
进口	统计数据,DBI，limma，光民，agricolae，RMySQL，DESeq2，SummarizedExperiment，gplots，计，S4Vectors
链接
建议	knitr，rmarkdown，data.table
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/AllenTiTaiWang/anamiR
BugReports	https://github.com/AllenTiTaiWang/anamiR/issues
全靠我
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	anamiR_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	anamiR_1.6.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	anamiR_1.6.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/anamiR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/anamiR/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档