ampliQueso

DOI:10.18129 / B9.bioc.ampliQueso

扩增子富集板分析

Bioconductor版本:Release (3.6)

该软件包提供了分析扩增子测序面板的工具和报告，如AmpliSeq

作者:Alicja Szabelska < Alicja。Szabelska在up.poznan.pl>;Marek Wiewiorka < Marek。Wiewiorka在gmail.com>;Michal Okoniewski < Michal at fgcz.ethz.ch>

维护者:Michal Okoniewski < Michal at fgcz.ethz.ch>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ampliQueso”)

文档

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browseVignettes(“ampliQueso”)

PDF	R脚本	ampliQueso底漆
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，RNASeq，ReportWriting，测序，软件，转录，可视化
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.15.0)，rnaSeqMap(> = 2.17.1),knitr，rgl，ggplot2，gplots平行,doParallel，foreach，VariantAnnotation，genefilter，statmod，xtable
进口	刨边机，DESeq，samr
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ampliQueso_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	ampliQueso_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ampliQueso_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ampliQueso
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ampliQueso/
软件包下载报告	下载数据