高山

doi:10.18129/b9.bioc.alpine

高山

生物导体版本:版本(3.6)

片段序列偏置建模和RNA-seq转录物丰度估计的校正。

作者:迈克尔·洛夫(Michael Love),拉斐尔·艾里萨里(Rafael Irizarry)

维护者:迈克尔·洛夫(Michael Love)

引用(从r内,输入引用(“高山”)):

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细节

生物浏览 替代方案,,,,批处理效应,,,,覆盖范围,,,,差速器,,,,基因表达,,,,正常化,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录,,,,可视化
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(1。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.3)
进口 生物弦,,,,iranges,,,,基因组机,,,,基因组签名,,,,rsamtools,,,,总结性特征,,,,GenomicFeatures,,,,Speedglm,花键,图形,,,,rbgl,,,,Stringr,统计,方法,图形,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,Alpinedata,,,,rtracklayer,,,,Ensembldb,,,,bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38,,,,rcolorbrewer
系统要求
增强
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源包 alpine_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 alpine_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) alpine_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alpine
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/alpine/
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