副词

doi:10.18129/b9.bioc.affy

Affymetrix寡核苷酸阵列的方法

生物导体版本:版本(3.6)

该软件包包含用于探索性寡核苷酸阵列分析的功能。对tkwidgets的依赖性仅涉及几乎没有便利功能。没有它,“ affy”是完全功能的。

作者:Rafael A. Irizarry ,laurent Gautier ,Benjamin Milo Bolstad with with picr.man.ac.uk> with with withMagnus Astrand ,Leslie M. Cope ,Robert Gentleman,Jeff Gentry,Jeff Gentry,Conrad Halling,Conrad Halling ,wolfggang Huber,James Macdonald ,Benjamin I. P. Rubinstein,Christopher Workman ,John Zhang

维护者:Rafael A. Irizarry

引用(从r内,输入引用(“ affy”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ affy”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ affy”)

PDF R脚本 1.底漆
PDF R脚本 2.内置处理方法
PDF R脚本 3.自定义处理方法
PDF R脚本 4.导入方法
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,软件
版本 1.56.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 13年)
执照 LGPL(> = 2.0)
要看 r(> = 2.8.0),生物基因(> = 0.1.12),生物酶(> = 2.5.5)
进口 affyio(> = 1.13.3),Biocinstaller,图形,grdevices,方法,预处理,统计,utils,Zlibbioc
链接 预处理
建议 tkwidgets(> = 1.19.0),Affydata,,,,小部件
系统要求
增强
URL
取决于我 Affycontam,,,,Affydata,,,,AffyExpress,,,,艾爱,,,,affypdnn,,,,affyplm,,,,Affyqcreport,,,,伴侣,,,,agimicrorna,,,,allmll,,,,altcdfenvs,,,,ampaffyexample,,,,arraymvout,,,,Arraytools,,,,BGX,,,,Bronchialil13,,,,CCTORIAL,,,,嵌合体脑,,,,Cll,,,,Cormotif,,,,策划的布拉德达塔,,,,策展人,,,,drugvsdisease,,,,双重,,,,生态酮,,,,eximir,,,,农场,,,,Frmatools,,,,GCRMA,,,,Hiiragi2013,,,,lmgene,,,,logitt,,,,mapredictdsc,,,,maqcsubset,,,,maqcsubsetafx,,,,maskbad,,,,MLP,,,,mvoutdata,,,,,,,,plw,,,,Prebs,,,,predasampledata,,,,Pumadata,,,,qpcrnorm,,,,readqpcr,,,,refplus,,,,RHVDM,,,,Risa,,,,RPA,,,,扫描,,,,简单,,,,斯派金,,,,SpikeInsubset,,,,SScore,,,,斯塔尔,,,,Webbioc,,,,XHYBCASNEUF
进口我 Affycoretools,,,,Affyilm,,,,affylmgui,,,,Affyqcreport,,,,ArrayQualityMetrics,,,,Arraytools,,,,咖啡店,,,,chipxpress,,,,coexnet,,,,Cormotif,,,,杂交,,,,Desousa2013,,,,Doscheda,,,,埃加德,,,,农场,,,,FFPE,,,,FRMA,,,,GCRMA,,,,GeoSubsiend,,,,刺激性,,,,htqpcr,,,,Icheck,,,,Lumi,,,,lvsmirna,,,,makecdfenv,,,,mimager,,,,MSNBase,,,,佩卡,,,,钳子,,,,plw,,,,彪马,,,,PVAC,,,,RCGH,,,,rnits,,,,简单,,,,stategra,,,,蒂格拉里,,,,涡轮瘤,,,,VSN,,,,波动
建议我 注释,,,,ArrayExpress,,,,Beadarray,,,,Beadarraysnp,,,,生物探测,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,BufferedMatrixMethods,,,,类别Compare,,,,Ecolitk,,,,雌激素,,,,ExpressionView,,,,事实设计,,,,ffpeexampledata,,,,gcmapweb,,,,Generegionscan,,,,林玛,,,,制造4,,,,mlseq,,,,Onechannelgui,,,,Paxtoolsr,,,,钢琴,,,,preda,,,,PROT2D,,,,QCMetrics,,,,runibic,,,,siggenes,,,,tcgabiolinks
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 affy_1.56.0.tar.gz
Windows二进制 affy_1.56.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) affy_1.56.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affy
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/affy/
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