acde

DOI:10.18129 / B9.bioc.acde

差异表达基因的人工成分检测

Bioconductor版本:Release (3.6)

该软件包为检测基因表达数据中的差异表达基因提供了一种多元推理分析方法。它使用人工成分，接近数据的主成分，但在差异基因表达方面有准确的解释，以识别差异表达基因，同时控制错误发现率(FDR)。此包中的方法在小插图或J. P. Acosta, L. Lopez-Kleine和S. Restrepo(2015年，待发)的文章“基因表达实验中差异表达基因推断鉴定的多元方法”中描述。

作者:Juan Pablo Acosta, Liliana Lopez-Kleine

维护者:Juan Pablo Acosta

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“acde”)

文档

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browseVignettes(“acde”)

PDF	R脚本	人工成分差异表达基因的鉴定
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，微阵列，PrincipalComponent，软件，TimeCourse，mRNAMicroarray
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3)，引导(> = 1.3)
进口	统计数据、图形
链接
建议	BiocGenerics，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	coexnet
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	acde_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	acde_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	acde_1.8.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/acde
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/acde/
软件包下载报告	下载数据