VariantTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.VariantTools

探索性分析工具变量调用

Bioconductor版本:版本(3.6)

探索,诊断,并比较不同调用使用过滤器。

作者:迈克尔·劳伦斯,耶利米Degenhardt,罗伯特先生

维护人员:迈克尔·劳伦斯< michafla gene.com >

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细节

biocViews	GeneticVariability,遗传学,测序,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges(> = 1.99.2),GenomicRanges(> = 1.17.7),VariantAnnotation(> = 1.11.16)方法
进口	Rsamtools(> = 1.17.6),BiocGenerics,Biostrings平行,GenomicFeatures(> = 1.17.13),矩阵,rtracklayer(> = 1.25.3),BiocParallel,GenomeInfoDb,BSgenome,Biobase
链接
建议	RUnit,LungCancerLines(> = 0.0.6),RBGL,图,gmapR(> = 1.13.4)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	HTSeqGenie
建议我	VariantToolsData
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	VariantTools_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	VariantTools_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	VariantTools_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/VariantTools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/VariantTools/
包下载报告	下载数据