变体滤波器
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doi：10.18129/b9
过滤编码和非编码遗传变体
生物导体版本：版本（3.6）
使用不同标准，例如遗传模型，氨基酸变化后果，人群中的次要等位基因频率，剪接部位的强度，保护等等过滤遗传变异。
作者：Robert Castelo [AUT，CRE]，Dei Martinez Elurbe [CTB]，Pau Puigdevall [CTB]
维护者：Robert Castelo
引用（从r内，输入引用（“ variantFiltering”））：
安装
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| R脚本 | 变体滤波器：滤波器编码和非编码遗传变体 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，遗传学，，，，高通量序列，，，，homo_sapiens，，，，SNP，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（4年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.0.0），方法，生物基因（> = 0.13.8），变体（> = 1.13.29） |
| 进口 | utils，生物酶，，，，S4VECTORS（> = 0.9.25），iranges（> = 2.3.23），rbgl，，，，图形，，，，AnnotationDbi，，，，生物比较，，，，生物弦（> = 2.33.11），GenomeInfodB（> = 1.3.6），基因组机（> = 1.19.13），总结性特征，，，，GenomicFeatures，，，，rsamtools（> = 1.17.8），BSGENOME，，，，GVIZ，，，，闪亮的，，，，GenomicsCores（> = 1.0.0） |
| 链接 | S4VECTORS，，，，iranges，，，，xvector，，，，生物弦 |
| 建议 | 运行，，，，生物使用，，，，org.hs.eg.db，，，，bsgenome.hsapiens.1000genomes.hs37d5，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37，，，，mafdb.1kgenomes.phase1.hs37d5，，，，phastcons100way.ucsc.hg19，，，，polyphen.hsapiens.dbsnp131，，，，sift.hsapiens.dbsnp137 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/rcastelo/variantfiltering |
| BugReports | https://github.com/rcastelo/variantfiltering/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | variantFiltering_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | variantFiltering_1.14.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | variantFiltering_1.14.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/variantfiltering |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/variantfiltering/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
