tarseqqc

doi:10.18129/b9.bioc.tarseqqc

有针对性的测序实验质量控制

生物导体版本:版本(3.6)

该软件包允许在R中表示有针对性的实验。这是基于当前包装的,并结合了对这种实验的质量控制和对测序区域的快速探索。XLSX文件作为输出生成。

作者:Gabriela A. Merino,Cristobal Fresno,Yanina Murua,Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez

维护者:bdmg.com.ar>的Gabriela Merino

引用(从r内,输入引用(“ tarseqqc”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ tarseqqc”)

文档

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browsevignettes(“ tarseqqc”)

PDF R脚本 TARSEQQC:目标测序实验质量控制
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,覆盖范围,,,,DataImport,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件,,,,目标征服,,,,可视化
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(2。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.4.1),方法,基因组机,,,,rsamtools(> = 1.20.4),GGPLOT2,,,,plyr,,,,OpenXLSX
进口 grdevices,统计,utils,S4VECTORS,,,,iranges,,,,生物基因,,,,RESHAPE2,,,,GenomeInfodB,,,,生物比较,,,,生物弦,,,,牛仔图,图形,基因组签名,,,,HMISC
链接
建议 运行
系统要求
增强
URL http://www.bdmg.com.ar
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 tarseqqc_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 TARSEQQC_1.8.0.ZIP
Mac OS X 10.11(El Capitan) TARSEQQC_1.8.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tarseqqc
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/tarseqqc/
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