SeqGSEA

DOI:10.18129 / B9.bioc.SeqGSEA

基因集富集分析(GSEA) RNA-Seq数据:积分微分表达式和拼接

Bioconductor版本:版本(3.6)

包通常提供高通量的基因集富集方法分析RNA-Seq数据通过积分微分表达式和拼接。它使用负二项分布模型读取计算数据,占测序偏见和生物变异。基于排列测试,统计显著性也可以实现对每个基因的微分表达式和拼接,分别。

作者:ξ王<ξ。王在newcastle.edu.au >

维护人员:ξ王<ξ。王在mdc-berlin.de >

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PDF	R脚本	基因集富集分析RNA-Seq SeqGSEA包数据
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文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,RNASeq,测序,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	Biobase,doParallel,DESeq
进口	方法,biomaRt
链接
建议	easyRNASeq,GenomicRanges
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

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源包	SeqGSEA_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	SeqGSEA_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	SeqGSEA_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SeqGSEA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SeqGSEA/
包下载报告	下载数据