- 首页
- Bioconductor 3.6
- 软件包
- SeqArray
SeqArray
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.SeqArray
全基因组序列变异呼叫的大数据管理
Bioconductor版本:Release (3.6)
数千个个体的全基因组测序变异调用的大数据管理:基因型数据(如snv、indes和结构变异调用)和SeqArray文件中的注释以面向数组和压缩的方式存储，使用R编程语言进行高效的数据访问。
作者:郑秀文[aut, cre]， Stephanie Gogarten [aut]， David Levine [ctb]， Cathy Laurie [ctb]
维护者:郑秀文
引文(从R内，输入引用(“SeqArray”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SeqArray”)
文档
| 超文本标记语言 | R脚本 | R集成 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | SeqArray数据格式和访问 |
| 超文本标记语言 | SeqArray概述 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataRepresentation，遗传学，基础设施，测序，软件 |
| 版本 | 1.18.2 |
| 在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.3.0)，gdsfmt(> = 1.10.1) |
| 进口 | 方法、并行IRanges，GenomicRanges，GenomeInfoDb，Biostrings，S4Vectors |
| 链接 | gdsfmt |
| 建议 | 消化，蜡笔，RUnit，knitr，Rcpp，SNPRelate，Biobase，BiocParallel，BiocGenerics，VariantAnnotation |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://github.com/zhengxwen/SeqArray |
| BugReports | http://github.com/zhengxwen/SeqArray/issues |
| 全靠我 | SeqVarTools |
| 进口我 | 《创世纪》 |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | SeqArray_1.18.2.tar.gz |
| Windows二进制 | SeqArray_1.18.2.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | SeqArray_1.18.2.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SeqArray |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SeqArray/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.6的旧源包 | 源存档 |
