SamSPECTRAL

DOI:10.18129 / B9.bioc.SamSPECTRAL

识别的细胞群在流式细胞仪的数据。

Bioconductor版本:版本(3.6)

大数据样本,谱聚类是可能的,同时保留在边密度信息。更具体地说,鉴于矩阵坐标作为输入,SamSPECTRAL首先构建社区样本数据点。然后,它构建一个图和加权后的边缘电导计算,图形传递给一个经典的谱聚类算法找到光谱集群。SamSPECTRAL的最后阶段是结合光谱集群。由此产生的“连接组件”估计生物细胞种群的数据样本。有关手动安装的说明,参考以下文档中提供的PDF文件。

作者:Habil Zare和Parisa Shooshtari

维护人员:Habil Zare < Zare txstate.edu >

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PDF	R脚本	修改后的谱聚类方法聚类数据流式细胞术
PDF		参考手册

细节

biocViews	癌症,CellBiology,聚类,FlowCytometry,艾滋病毒,软件,干细胞的
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(8年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.3.3)
进口	方法
链接
建议
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增强了
URL
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进口我	承认
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SamSPECTRAL_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	SamSPECTRAL_1.32.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	SamSPECTRAL_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SamSPECTRAL
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SamSPECTRAL/
包下载报告	下载数据