SNPchip

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPchip

副本编号更改的可视化

Bioconductor版本:Release (3.6)

用于绘制SNP阵列数据的函数;由于历史原因而保留

作者:Robert Scharpf 和Ingo Ruczinski

维护者:Robert Scharpf

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPchip”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SNPchip”)

PDF	R脚本	绘制染色体组型
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation，GeneticVariability，单核苷酸多态性，软件，可视化
版本	2.24.0
在Bioconductor	BioC 2.0 (R-2.5)(11年)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.14.0)
进口	方法、图形晶格、网格foreach跑龙套,Biobase，S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，SummarizedExperiment，oligoClasses(> = 1.31.1)
链接
建议	crlmm(> = 1.17.14),RUnit
SystemRequirements
增强了	doSNOW，VanillaICE(> = 1.21.24),RColorBrewer
URL	http://www.biostat.jhsph.edu/~iruczins/software/snpchip.html
全靠我	mBPCR
进口我	crlmm，phenoTest
建议我	类别，MinimumDistance，oligoClasses，VanillaICE
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SNPchip_2.24.0.tar.gz
Windows二进制	SNPchip_2.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SNPchip_2.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SNPchip
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SNPchip/
软件包下载报告	下载数据