SIMLR

DOI:10.18129 / B9.bioc.SIMLR

题目:SIMLR和CIMLR多核学习方法

Bioconductor版本:Release (3.6)

在这个包中，我们提供了SIMLR和CIMLR的实现。这些方法最初应用于单细胞和癌症基因组数据，但原则上它们能够有效和高效地学习所有背景下的相似性，在这些背景下，数据的多样性和异质统计特征使标准方法更难解决问题。

作者:Daniele Ramazzotti [aut, cre]， Bo Wang [aut]， Luca De Sano [aut]， Serafim Batzoglou [ctb]

维护者:Daniele Ramazzotti < Daniele。Ramazzotti在yahoo.com>

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("SIMLR")

文档

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browseVignettes(“SIMLR”)

PDF	R脚本	SIMLR和CIMLR多核学习方法
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，测序，SingleCell，软件
版本	1.4.1
在Bioconductor公司	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	文件许可
取决于	R (>= 3.4)
进口	平行,矩阵，统计数据，方法，Rcpp，pracma，RcppAnnoy，RSpectra
链接	Rcpp
建议	BiocGenerics，BiocStyle，testthat，knitr，igraph
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/BatzoglouLabSU/SIMLR
BugReports	https://github.com/BatzoglouLabSU/SIMLR
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	SIMLR_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	SIMLR_1.4.1.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SIMLR_1.4.1.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/SIMLR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SIMLR/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档