RQC

doi:10.18129/b9.bioc.rqc

高通量测序数据的质量控制工具

生物导体版本:版本(3.6)

RQC是一种优化的工具,旨在用于质量控制和评估高通量测序数据。它执行整个文件的并行处理,并产生包含一组高分辨率图形的报告。

作者:Welliton Souza,Benilton Carvalho

维护者:welliton souza

引用(从r内,输入引用(“ RQC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rqc”)

文档

html R脚本 使用RQC
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(3.5岁)
执照 GPL(> = 2)
要看 生物比较,,,,Shortread,,,,GGPLOT2
进口 生物基因,,,,生物弦,,,,iranges, 方法,S4VECTORS,,,,尼特(> = 1.7),生物使用,,,,plyr,,,,降价, 网格,RESHAPE2,,,,消化,,,,RCPP(> = 0.11.6),Biovizbase,,,,闪亮的,,,,rsamtools,,,,基因组签名,,,,Genomicfiles
链接 RCPP
建议 测试
系统要求
增强
URL https://github.com/labbcb/rqc
BugReports https://github.com/labbcb/rqc/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 RQC_1.12.0.TAR.GZ
Windows二进制 RQC_1.12.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) RQC_1.12.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rqc
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rqc/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网