RpsiXML

DOI:10.18129 / B9.bioc.RpsiXML

PSI-MI 2.5 R接口文件

Bioconductor版本:版本(3.6)

查询,数据结构和接口交互的可视化数据集。这个包inplements PSI-MI 2.5标准和支持到现在8数据库。进一步的数据库支持PSI-MI 2.5标准将不断增加。

作者:大卫•张Jitao Stefan Wiemann马克•卡尔森托尼蒋介石的贡献

维修工:Jitao大卫张< jitao_david。张在roche.com >

从内部引用(R,回车引用(“RpsiXML”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“RpsiXML”)

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PDF R脚本 RpsiXML方案的应用实例
PDF R脚本 阅读PSI-25 XML文件
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 基础设施,蛋白质组学,软件
版本 2.20.0
Bioconductor自 BioC 2.3 (r - 2.8)(9.5年)
许可证 LGPL-3
取决于 方法,注释(> = 1.21.0),(> = 1.21.0),Biobase,RBGL(> = 1.17.0),XML(> =测试盒框),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi
进口
链接
建议 org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,hom.Hs.inp.db,hom.Mm.inp.db,hom.Dm.inp.db,hom.Rn.inp.db,hom.Sc.inp.db,Rgraphviz,ppiStats,ScISI
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com
取决于我 ScISI
进口我 ScISI
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 RpsiXML_2.20.0.tar.gz
Windows二进制 RpsiXML_2.20.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) RpsiXML_2.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RpsiXML
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RpsiXML/
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