RnBeads

DOI:10.18129 / B9.bioc.RnBeads

RnBeads

Bioconductor版本:版本(3.6)

RnBeads促进综合分析各类在基因组DNA甲基化数据规模。

作者:亚森Assenov (aut) Pavlo Lutsik (aut),迈克尔·谢勒(aut),费边穆勒(aut (cre)

维修工:费边穆勒< rnbeads在mpi-inf.mpg.de >

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PDF	R脚本	综合与RnBeads DNA甲基化分析
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文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect,CpGIsland,DNAMethylation,DataImport,DifferentialMethylation,表观遗传学,MethylSeq,MethylationArray,预处理,质量控制,测序,软件,TwoChannel
版本	1.10.8
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.0.0),BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.25),GenomicRanges,质量,集群,ff,字段,ggplot2(> = 0.9.2),gplots,gridExtra,limma,matrixStats、方法、illuminaio,methylumi,plyr
进口	IRanges
链接
建议	类别,GOstats,Gviz,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,RPMM,RefFreeEWAS,RnBeads.hg19,XML,注释,biomaRt,foreach,doParallel,ggbio,isva,mclust,mgcv,minfi,nlme,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db,quadprog,rtracklayer,qvalue,股东价值分析,西瓜,wordcloud,argparse,glmnet,很高兴,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,尺度,missMethyl,嫁祸于,闪亮的,shinyjs,plotrix,hexbin,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	RnBeads.hg19,RnBeads.hg38,RnBeads.mm10,RnBeads.mm9,RnBeads.rn5
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包档案

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源包	RnBeads_1.10.8.tar.gz
Windows二进制	RnBeads_1.10.8.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	RnBeads_1.10.8.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RnBeads
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RnBeads/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.6源码包	源存档