Risa

DOI:10.18129 / B9.bioc.Risa

将实验元数据从ISA-tab转换为Bioconductor数据结构

Bioconductor版本:Release (3.6)

以制表符分隔的调查/研究/化验(ISA)格式是一种通用框架,用于收集和交流复杂的元数据(即样本特征、使用的技术、所做的测量类型),这些元数据来自使用从传统方法到高通量技术的技术组合的实验。Risa允许以ISA-Tab格式访问元数据/数据,并构建Bioconductor数据结构。目前,支持来自微阵列、流式细胞仪和代谢组学(即质谱)分析的数据。该软件包是可扩展的,正在努力支持与蛋白质组学分析相关的元数据。

作者:Alejandra Gonzalez-Beltran, Audrey Kauffmann, Steffen Neumann, Gabriella Rustici, ISA团队

维护者:Alejandra Gonzalez-Beltran < Alejandra .gonzalez。Beltran在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(Risa)):

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Risa”)

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PDF R脚本 Risa:将实验元数据从ISA-tab转换为Bioconductor数据结构
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细节

biocViews 注释DataImportMassSpectrometry软件
版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(5.5年)
许可证 LGPL
取决于 R (>= 2.0.9),Biobase(>= 2.4.0),Rcpp(> = 0.9.13),biocViewsaffy
进口 xcms
链接
建议 faahKO(> = 1.2.11)
SystemRequirements
增强了
URL http://www.isa-tools.org/
BugReports https://github.com/ISA-tools/Risa/issues
全靠我
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构建报告

包档案

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源包 Risa_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 Risa_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) Risa_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Risa
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Risa/
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