生物导体版本:版本(3.6)
包装铃声促进了芯片芯片数据的主要分析。包装的主要功能是数据读数,质量评估,数据可视化和基因组区域的识别,显示了CHIP-CHIP中的富集。该软件包具有处理芯片芯片项目中使用的Nimblegen的两色寡核苷酸微阵列的功能,但鉴于数据以RGLIST(RGLIST(RAW)或expressionset(pre-pre-pre-predionset)提供(pre-pre-prectionset)(pre-chip-chip数据分析)(pre-chip-chip数据分析)(处理)。该软件包采用了来自生物导体项目的其他各种软件包的功能,并提供了其他芯片芯片特异性和敏捷特异性功能。
作者:Joern Toedling,Oleg Sklyar,Tammo Krueger,Matt Ritchie,Wolfgang Huber
维护者:J。Toedling
引用(从r内,输入引用(“林戈”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ringo”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Ringo”)
R脚本 | r对敏捷寡聚的调查 | |
参考手册 |
生物浏览 | DataImport,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,两通道 |
版本 | 1.42.1 |
在生物导体中 | Bioc 2.0(R-2.5)(11年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 方法,生物酶(> = 1.14.1),rcolorbrewer,,,,林玛,,,,矩阵, 网格,格子 |
进口 | 生物基因(> = 0.1.11),GeneFilter,,,,林玛,,,,VSN,Stats4 |
链接 | |
建议 | rtracklayer(> = 1.3.1),mclust,,,,topgo(> = 1.15.0) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | CCTORIAL,,,,simbindprofiles,,,,斯塔尔 |
进口我 | repitools |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ringo_1.42.1.tar.gz |
Windows二进制 | ringo_1.42.1.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | ringo_1.42.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ringo |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ringo/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
Bioc 3.6的旧源软件包 | 来源存档 |