Reactomepa
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.reaeactomepa
Reactome途径分析
生物导体版本：版本（3.6）
该软件包为基于Reactome Pathway数据库的途径分析提供了功能。它实现了富集分析，基因集富集分析和可视化的几种函数。
作者：广琴Yu [AUT，CRE]，Vladislav Petyuk [CTB]
维护者：gmail.com> guangchuang yu
引用（从r内，输入引用（“ reactomepa”））：
安装
要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ https：//www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ reactionomepa”）
文档
| html | R脚本 | R反应途径分析的R包装 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，基因烯，，，，多重组合，，，，途径，，，，Reactome，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.10（R-2.15）（6年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 依靠 | r（> = 3.3.1），剂量（> = 3.0.0） |
| 进口 | AnnotationDbi，，，，Reactome.db，，，，Igraph，，，，石墨 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，clusterProfiler，，，，尼特，，，，org.hs.eg.db，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://guangchuangyu.github.io/reactomepa |
| BugReports | https://github.com/guangchuangyu/reactomepa/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 生物加工者，，，，林，，，，mirsponge |
| 建议我 | Chipseeker，，，，Cindex，，，，clusterProfiler |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | reactomepa_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | reactomepa_1.22.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | ReactOMEPA_1.22.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/reactomepa |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/reactomepa/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
