rnaprobr

doi:10.18129/b9.bioc.rnaprobr

用于分析基于大规模平行测序的RNA结构探测数据的R包装

生物导体版本:版本(3.6)

该软件包促进了对下一代测序数据的分析,该数据的位置信息具有单个核苷酸分辨率是关键。它允许在表或UCSC兼容的床上图文件中应用不同类型的相关正常化,数据可视化和导出。

作者:Lukasz Jan Kielpinski [AUT],Nikos Sidiropoulos [Cre,Aut],Jeppe Vinther [aut]

维护者:nikos sidiropoulos

引用(从r内,输入引用(“ rnaprobr”)):

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PDF R脚本 RNAPROBR:用于分析基于大规模平行测序的RNA结构探测方法的R包装
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,基因数,,,,正常化,,,,测序,,,,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(3年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.1.1),GenomicFeatures(> = 1.16.3),plyr(> = 1.8.1),生物基因(> = 0.10.0)
进口 生物弦(> = 2.32.1),基因组机(> = 1.16.4),iranges(> = 2.10.5),rsamtools(> = 1.16.1),rtracklayer(> = 1.24.2),基因组签名(> = 1.5.12),S4VECTORS(> = 0.14.7),图形,统计,utils
链接
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源包 rnaprobr_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 rnaprobr_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) rnaprobr_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaprobr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaprobr/
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