RJMCMCN核小体

doi:10.18129/b9.bioc.rjmcmcmcnucleosys

具有高通量短阅读数据(MNase-Seq)的全基因组核小体定位的贝叶斯分层模型(MNase-Seq)

生物导体版本:版本(3.6)

该软件包在T混合物中使用信息性的多项式 - 迪里奇LET进行核小体定位,并具有可逆的跳跃估计全基因组分析的核小体位置的跳跃估计。

作者:Pascal Belleau [aut],Rawane Samb [aut],AstridDeschê​​nes[Cre,Aut],Khader Khadraoui [aut],Lajmi Lakhal-Chaieb [aut],Arnaud Droit [aut]

维护者:Astriddeschê​​nes>

引用(从r内,输入引用(“ rjmcmcmcnucleosomes”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rjmcmcmcnucleosomes”)

文档

html R脚本 核小体定位
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,生物问题,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,核粉置换,,,,测序,,,,软件,,,,统计信息
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(1年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.4),iranges,,,,基因组机
进口 RCPP(> = 0.12.5),共识,,,,生物基因,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS,,,,生物比较,统计,图形,方法,grdevices
链接 RCPP
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,核素,,,,运行
系统要求 RCPP
增强
URL https://github.com/arnauddroitlab/rjmcmcmcmcnucleosames
BugReports https://github.com/arnauddroitlab/rjmcmcmcmcnucleosomes/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

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源包 rjmcmcnucleosomes_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 rjmcmcnucleosomes_1.2.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) rjmcmcnucleosomes_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rjmcmcmcnucleosomes
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rjmcmcmcmcnucleosomes/
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