R453plus1toolbox

doi:10.18129/b9.bioc.r453plus1toolbox

用于导入和分析罗氏基因组序列系统数据的软件包

生物导体版本:版本(3.6)

R453PLUS1工具箱包括有用的功能,用于分析Roche的454测序平台生成的数据。它为质量保证以及检测到的变体的注释和可视化添加了功能,并补充了Roche与其产品一起运送的软件工具。此外,还提供了检测结构变体的管道。

作者:汉斯·乌尔里希·克莱因(Hans-Ulrich Klein),克里斯托夫·巴滕哈根(Christoph Bartenhagen),克里斯蒂安

维护者:hans-ulrich klein

引用(从r内,输入引用(“ R453plus1toolbox”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ r453plus1toolbox”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ R453plus1toolbox”)

PDF R脚本 用于导入和分析罗氏基因组序列系统数据的软件包
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,基础设施,,,,QualityControl,,,,报告写作,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.28.1
在生物导体中 Bioc 2.7(R-2.12)(7。5年)
执照 LGPL-3
要看 r(> = 2.12.0),方法,变体,,,,生物弦,,,,生物酶
进口 UTILS,GRDEVICES,图形,统计,工具,Xtable,,,,R2HTML,,,,Deachertimos,,,,生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),iranges,,,,xvector,,,,基因组机,,,,总结性特征,,,,Biomart,,,,BSGENOME,,,,rsamtools,,,,Shortread
链接
建议 rtracklayer,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER2
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 r453plus1toolbox_1.28.1.tar.gz
Windows二进制 r453plus1toolbox_1.28.1.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) r453plus1toolbox_1.28.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/r453plus1toolbox
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/r453plus1toolbox/
软件包下载报告 下载统计
Bioc 3.6的旧源软件包 来源存档

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网