Pbase

DOI:10.18129 / B9.bioc.Pbase

操纵和探索蛋白质和蛋白质组学数据

Bioconductor版本:Release (3.6)

在蛋白质组学实验的背景下，研究和理解蛋白质序列数据的一组类和功能。

作者:Laurent Gatto [aut]， Sebastian Gibb [aut, cre]

维护者:Sebastian Gibb ， Laurent Gatto

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文档

超文本标记语言	R脚本	Pbase数据
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文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，基础设施，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件，可视化
版本	0.18.0
在Bioconductor中	BioC 3.1 (R-3.2)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10)， methods;BiocGenerics，Rcpp，Gviz
进口	切肉刀(> = 1.3.6),Biobase，Biostrings，IRanges，S4Vectors，mzID，mzR(> = 1.99.1),MSnbase(> = 1.15.5),Pviz，biomaRt，GenomicRanges，rtracklayer，ensembldb(> = 1.99.13),BiocParallel，AnnotationFilter
链接
建议	testthat(> = 0.8),ggplot2，BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，AnnotationHub，knitr，rmarkdown，BiocStyle，EnsDb.Hsapiens.v86(> = 2.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ComputationalProteomicsUnit/Pbase
BugReports	https://github.com/ComputationalProteomicsUnit/Pbase/issues
这取决于我
进口我
建议我
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包档案

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源包	Pbase_0.18.0.tar.gz
Windows二进制	Pbase_0.18.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Pbase_0.18.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/Pbase
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Pbase/
软件包下载报告	下载数据