路径网

doi:10.18129/b9.bioc.pathnet

使用拓扑信息进行途径分析的R包装

生物导体版本:版本(3.6)

路径网使用基因的途径和差异表达水平(从微阵列实验获得)中存在拓扑信息,以识别1)显着富集和2)在差异表达的背景下相互关联的途径。该算法在:PathNet:使用拓扑信息进行途径分析的工具中描述。Dutta B,Wallqvist A和Reifman J.生物学和医学的源代码2012年9月24日; 7(1):10。

作者:bhaskar dutta ,anders wallqvist ,jaques reifman >>

维护者:Jason B. Smith

引用(从r内,输入引用(“路径网”)):

安装

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PDF R脚本 路径网
PDF 参考手册

细节

生物浏览 差异性,,,,kegg,,,,多重组合,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 1.14.0)
进口
链接
建议 Pathnetdata,,,,运行,,,,生物基因
系统要求
增强
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取决于我
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建议我
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源包 pathnet_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 PATHNET_1.18.0.ZIP
Mac OS X 10.11(El Capitan) pathnet_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathnet
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/pathnet/
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