PGSEA

DOI:10.18129 / B9.bioc.PGSEA

参数基因集富集分析

Bioconductor版本:版本(3.6)

参数分析的基因集富集

作者:凯尔Furge <凯尔。furge vai.org >和卡尔Dykema <卡尔。在vai.org dykema >

维护人员:卡尔Dykema <卡尔。在vai.org dykema >

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PDF	R脚本	HOWTO: PGSEA
PDF	R脚本	HOWTO: PGSEA工作流示例
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,软件
版本	1.52.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(11年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10),GO.db,KEGG.db,AnnotationDbi,annaffy、方法、Biobase(> = 2.5.5)
进口
链接
建议	GSEABase,GEOquery,org.Hs.eg.db,hgu95av2.db,limma
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	GeneExpressionSignature
进口我
建议我	gskb
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	PGSEA_1.52.0.tar.gz
Windows二进制	PGSEA_1.52.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	PGSEA_1.52.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PGSEA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PGSEA/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.6源码包	源存档