OrganismDbi

DOI:10.18129 / B9.bioc.OrganismDbi

软件使光滑连接不同的数据库包

Bioconductor版本:版本(3.6)

包允许一个简单的统一界面几个注释包每个有自己的模式通过利用这样的事实,这些包实现了选择方法。

作者:马克•卡尔森Herve页,瓦莱丽Obenchain马丁•摩根

维护人员:Biocore数据团队<维护者bioconductor.org >

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“OrganismDbi”)

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PDF	R脚本	OrganismDbi:元注释框架包
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文本		新闻

细节

biocViews	注释,基础设施,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.14.0)、方法BiocGenerics(> = 0.15.10),AnnotationDbi(> = 1.33.15),GenomicFeatures(> = 1.23.31)
进口	Biobase,BiocInstaller,GenomicRanges,图,IRanges,RBGL,DBI,S4Vectors(> = 0.9.25),统计数据
链接
建议	Homo.sapiens,Rattus.norvegicus,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,AnnotationHub,FDb.UCSC.tRNAs,rtracklayer,biomaRt,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	Homo.sapiens,Mus.musculus,Rattus.norvegicus
进口我	AnnotationHubData,epivizrData,ggbio
建议我	ChIPpeakAnno,epivizrStandalone
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	OrganismDbi_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	OrganismDbi_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	OrganismDbi_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OrganismDbi
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/OrganismDbi/
包下载报告	下载数据