MotifDb

DOI:10.18129 / B9.bioc.MotifDb

一个带注释的Protein-DNA绑定序列的集合

Bioconductor版本:版本(3.6)

超过8000的带注释的位置频率矩阵来自13个公共资源,为多个生物。

作者:保罗•香农马特·理查兹

维修工:保罗·香农< pshannon systemsbiology.org >

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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	MotifAnnotation,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0 |文件许可
取决于	R(> = 2.15.0)、方法BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,Biostrings
进口	rtracklayer,splitstackshape
链接
建议	RUnit,seqLogo,MotIV
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	motifbreakR,trena
进口我	rTRMui
建议我	ATACseqQC,DiffLogo,MMDiff2,motifcounter,motifStack,profileScoreDist,PWMEnrich,rTRM,vtpnet
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MotifDb_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	MotifDb_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	MotifDb_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MotifDb
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MotifDb/
包下载报告	下载数据