海市蜃楼

DOI:10.18129 / B9.bioc.MiRaGE

MiRNA按基因表达排序

Bioconductor版本:Release (3.6)

该软件包包含了miRNA对靶基因调控的推断功能，仅基于靶基因表达谱。

作者:Y-h。Taguchi <标签在granular.com>

维护人员:Y-h。Taguchi <标签在granular.com>

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("MiRaGE")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“海市蜃楼”)

PDF	R脚本	如何使用MiRaGE软件包
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression，微阵列，RNASeq，圣人，测序，软件
版本	1.20.0
在Bioconductor公司	BioC 2.11 (R-2.15)(5.5年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 3.1.0)，Biobase(> = 2.23.3)
进口	BiocGenerics，S4Vectors，AnnotationDbi
链接
建议	seqinr(> = 3.0.7),biomaRt(> = 2.19.1),GenomicFeatures(> = 1.15.4),Biostrings(> = 2.31.3),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10，miRNATarget，humanStemCell，IRanges，GenomicRanges(> = 1.8.3),BSgenome，beadarrayExampleData
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MiRaGE_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	MiRaGE_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MiRaGE_1.20.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/MiRaGE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MiRaGE/
软件包下载报告	下载数据