Bioconductor版本:Release (3.6)
在记录3D荧光显微镜图像时,一个问题是如何在2D中正确地呈现这些结果。最大强度投影是确定图像中每个像素焦平面的常用方法。然而,这种方法的问题是,失焦的元素仍然是可见的,使得边缘和精细结构难以检测。这个包旨在通过使用给定像素周围的对比度来确定焦平面来解决这个问题,允许比其他可能的更清晰的结构检测。为了方便起见,这个包还包含执行各种其他类型投影的函数,包括最大强度投影。
作者:Jan Sauer, Bernd Fischer
维护者:Jan Sauer < Jan。绍尔在dkfz-heidelberg.de>
引文(从R内,输入引用(“MaxContrastProjection”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MaxContrastProjection”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MaxContrastProjection”)
R脚本 | MaxContrastProjection | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBasedAssays,预处理,软件,可视化 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(1年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.4) |
进口 | EBImage、统计数据、方法 |
链接 | |
建议 | knitr,BiocStyle,testthat |
SystemRequirements | GNU使 |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MaxContrastProjection_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | MaxContrastProjection_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | MaxContrastProjection_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MaxContrastProjection |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MaxContrastProjection/ |
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