MatrixRider

DOI:10.18129 / B9.bioc.MatrixRider

获得总亲和力和入住率对给定矩阵结合位点序列

Bioconductor版本:版本(3.6)

计算一个数字整整一个序列,反映了DNA结合蛋白相互作用的倾向。DNA结合蛋白与烤瓷矩阵描述,例如从Jaspar得到。

作者:埃琳娜格拉希

维护人员:埃琳娜·葛拉<葛。在gmail.com e >

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PDF	R脚本	亲和力和入住率
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation,遗传学,MotifAnnotation,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.1.2)
进口	方法,TFBSTools,IRanges,XVector,Biostrings
链接	IRanges,XVector,Biostrings,S4Vectors
建议	RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,JASPAR2014
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

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源包	MatrixRider_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	MatrixRider_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	MatrixRider_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MatrixRider
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MatrixRider/
包下载报告	下载数据