MSstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstats

蛋白质意义分析的DDA、SRM和DIA Label-free或基于标签的蛋白质组学实验

Bioconductor版本:版本(3.6)

一组工具,您相对蛋白质意义的统计分析,SRM和DIA实验。

作者:之一Meena崔(aut (cre),西里尔Galitzine (aut) Tsung-Heng蔡(aut),奥尔加Vitek (aut)

维护人员:之一Meena崔< mnchoi67 gmail.com >

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文档

HTML	R脚本	MSstats:蛋白质/肽意义分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	MassSpectrometry,归一化,蛋白质组学,质量控制,软件,TimeCourse
版本	3.10.6
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4)
进口	Rcpp,lme4,marray,limma,gplots,ggplot2、方法、网格ggrepel,preprocessCore,MSnbase,reshape2,生存,minpack.lm跑龙套,grDevices、图形数据,doSNOW,雪,foreach,data.table,质量,dplyr,tidyr,purrr,stringr,扫帚
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	http://msstats.org
BugReports	https://groups.google.com/forum/ # ! / msstats论坛
取决于我
进口我
建议我	MSstatsBioData
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MSstats_3.10.6.tar.gz
Windows二进制	MSstats_3.10.6.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	MSstats_3.10.6.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstats
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MSstats/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.6源码包	源存档