MLSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.MLSeq

RNA-Seq数据的机器学习接口

Bioconductor版本:Release (3.6)

该软件包应用了几种机器学习方法,包括SVM, bagSVM,随机森林和CART,用于RNA-Seq数据。

作者:Gokmen Zararsiz, Dincer Goksuluk, Selcuk Korkmaz, Vahap Eldem, Izzet Parug Duru, Turgay Unver, Ahmet Ozturk

维护:Gokmen Zararsiz

引文(从R内,输入引用(“MLSeq”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MLSeq”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MLSeq”)

PDF R脚本 MLSeq
PDF 参考手册
文本 自述

细节

biocViews 分类聚类RNASeq测序软件
版本 1.18.0
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(4年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 3.0.0),脱字符号DESeq2BiobaselimmarandomForest刨边机
进口 方法
链接
建议 knitre1071kernlab地球椭圆fastICAgam不小眷顾质量mdamgcvmlbenchnnet聚会,派对pROC代理RANN:affy
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 MLSeq_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 MLSeq_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) MLSeq_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MLSeq
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MLSeq/
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