米拉

DOI:10.18129 / B9.bioc.MIRA

Methylation-Based推理的监管活动

Bioconductor版本:版本(3.6)

米拉措施的程度“浸”围绕监管网站感兴趣的甲基化水平,如转录因子结合位点,为该类型的实例网站整个基因组,然后可以用来推断监管活动。

作者:内森·谢菲尔德< http://www.databio.org > (aut) Christoph烈性黑啤酒(施),约翰·劳森(aut (cre)

维护人员:约翰·劳森< jtl2hk virginia.edu >

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文档

HTML	R脚本	米拉应用到一个生物问题
HTML	R脚本	开始使用Methylation-based推理的监管活动
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,报道,DNAMethylation,表观遗传学,FunctionalGenomics,GeneRegulation,GenomeAnnotation,MethylSeq,测序,软件,SystemsBiology
版本	1.0.1
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.4)
进口	BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,data.table,ggplot2,Biobase统计数据,bsseq、方法
链接
建议	knitr平行,testthat,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了	simpleCache
URL	http://databio.org/mira
BugReports	https://github.com/databio/MIRA
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包档案

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源包	MIRA_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	MIRA_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	MIRA_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MIRA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MIRA/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.6源码包	源存档