M3D

doi:10.18129/b9.bioc.m3d

确定跨测试组的差异甲基化区域

生物导体版本:版本(3.6)

该软件包在统计学上确定了CPG的统计学显着差异化区域。它使用内核方法(最大平均差异)来测量甲基化曲线的差异,并将这些方法与重新复制变化联系起来,同时考虑了覆盖范围的变化。

作者:汤姆·梅奥

维护者:汤姆·梅奥(Tom Mayo)

引用(从r内,输入引用(“ M3D”)):

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PDF R脚本 M $^3 $ D方法的简介
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文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,CPGISLAND,,,,DNAMETHYLATY,,,,差甲基化,,,,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(3.5岁)
执照 艺术许可2.0
要看 r(> = 3.3.0)
进口 平行,RCPP,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机,,,,总结性特征,,,,Biseq
链接 RCPP
建议 生物使用,,,,尼特,,,,测试
系统要求
增强
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取决于我
进口我
建议我
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源包 m3d_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 m3d_1.12.0.zip(仅64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) m3d_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/m3d
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/m3d/
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