KEGGlincs

DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGlincs

可视化KEGG路径中的所有边并覆盖LINCS数据[选项]

Bioconductor版本:Release (3.6)

通过从KGML文件中获得的信息显式地重新创建路径映射，了解KEGG路径的“底层”发生了什么。

作者:莎娜·怀特

维护者:Shana White ， Mario Medvedovic

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“KEGGlincs”)

文档

超文本标记语言	R脚本	KEGGlincs工作流
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文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology，DataRepresentation，GeneExpression，GraphAndNetwork，KEGG，网络，NetworkInference，通路，软件，ThirdPartyClient
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3)，KOdata，hgu133a.db，org.Hs.eg.db(> = 3.3.0)
进口	AnnotationDbi，KEGGgraph，igraph，plyr，gtools，httr，RJSONIO，KEGGREST，方法，图形，统计，utils，XML, grDevices
链接
建议	BiocInstaller(> = 1.20.3),knitr，图
SystemRequirements	细胞景观(>= 3.3.0)，Java (>= 8)
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

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源包	KEGGlincs_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	KEGGlincs_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	KEGGlincs_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGlincs
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGlincs/
软件包下载报告	下载数据