ImmuneSpaceR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ImmuneSpaceR

免疫空间数据库的薄包装器

Bioconductor版本:Release (3.6)

提供一个方便的API，用于访问免疫空间(www.immunespace.org)中的数据集，免疫空间是人类免疫项目联盟(HIPC)的数据存储库和分析平台。

作者:Greg Finak [aut]， Renan Sauteraud [aut]， Mike Jiang [aut]， Gil Guday [aut]， Leo Dashevskiy [aut]， Evan Henrich [aut]， Ju Yeong Kim [aut]， Raphael Gottardo [aut]， ImmuneSpace Package Maintainer [cre, cph]

维护者:ImmuneSpace Package Maintainer < ImmuneSpace at gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ImmuneSpaceR”)

文档

超文本标记语言	R脚本	免疫空间包的介绍
超文本标记语言	R脚本	使用getDataset下载表
超文本标记语言	R脚本	用免疫空间处理表达矩阵
超文本标记语言	R脚本	使用ImmuneSpaceR重现在线报告:HAI与SDY269中流式细胞术的相关性
超文本标记语言	R脚本	使用ImmuneSpaceR重现在线报告:在SDY144中HAI/病毒中和滴度和细胞计数的相关性
超文本标记语言	R脚本	使用ImmuneSpaceR重现在线报告:SDY180中的浆母细胞丰度
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，软件，ThirdPartyClient
版本	1.6.2
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	GPL-2
取决于
进口	跑龙套、方法data.table，httr，Rlabkey(> = 2.1.136),Biobase，pheatmap，ggplot2，尺度统计数据,gtools，gplots，reshape2，情节，的热图(> = 0.7.0),rjson，rmarkdown，preprocessCore、并行
链接
建议	knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR
BugReports	https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR/issues
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ImmuneSpaceR_1.6.2.tar.gz
Windows二进制	ImmuneSpaceR_1.6.2.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ImmuneSpaceR_1.6.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ImmuneSpaceR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ImmuneSpaceR/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.6的旧源包	源存档